随着技术不断改进，兽用B超已经从传统处理器改为NiosⅡ处理器。NiosⅡ处理器是采用多级流水线技术的对SC结构，大多数指令可在一个时钟周期之内完成。在片内空间足够的情况下，设计人员可以轻松在设计中加入多个NiosⅡ处理器，提高了系统的处理能力。NiosⅡ是个软核，只要芯片上有足够的空间，就可以不断地进行CPU的升级而无需修改总体电路结构。综上可知，NiosⅡ有如下优点：
   (1)完整的开发工具套件；
   (2)灵活性、可裁剪性：
   (3)开发周期短：利用现成的IP核和软硬件并行设计；    (4)升级快、永不过时：软硬件分开设计，随着要求的提高，可以随时更改系统的配置；
   (5)成本低、性能好、体积小：只占用FPGA内部资源，减少PCB设计难度，增加可靠性。
传统的以兽用B超微处理器为核心而构成的嵌入式系统通常有如下缺点：
    (1)设计难度大。采用串行指令执行的方式，使得兽用B超系统的工作速度受限制，无法达到对日益增大的数据处理的需求。多处理器并行协调工作虽然能改善此状况，但是多处理并行工作将使得PCB设计和软件开发变得异常复杂。
    (2)升级难度大。兽用B超嵌入式系统一般在特定的时间针对特定的领域而设计开发，一旦需要升级换代，尤其是涉及升级微处理器时，软、硬件都必须全部重新设计。
    (3)开发周期长。兽用B超软件的开发必须等待硬件开发到一定阶段后才能进行，并且按照特定的硬件而开发的程序，其移植性差，从而导致软件编写重复性劳动增大。